青海省畜牧兽医科学院前身为1952年成立的青海省畜牧兽医诊断实验室，1959年更名为青海省畜牧兽医研究所，后更名为青海省畜牧兽医科学院。1980年，经省委省政府批准由县级建制改为厅局级建制，是青海省唯一的畜牧业综合性省级科研机构。

2000年11月整建制划归williamhill威廉希尔官网，试行大学领导下的二级研究院管理体制，为副厅级建制，由省教育厅主管，省科技厅、省农业厅、省畜牧厅、省林业局协管。继续保留青海省畜牧兽医科学院牌子，原机构设置保持不变，人员编制转为大学科研事业编制，事业经费预算由省财政核定基数戴帽下达。

2002年12月20日，青海省编制委员会下发《关于williamhill威廉希尔官网机构改革方案的批复》（青编委〔2002〕94号），青海省畜牧兽医科学院下设行政职能部门4个：办公室、组织人事处、科研管理处、财务处；科研机构3个：畜牧研究所、兽医研究所和草原研究所。重新核定定额补助事业编制172名，自收自支事业编制15名。

2018年2月14日，青海省机构编制委员会办公室下发《关于确定williamhill威廉希尔官网农林科学院 畜牧兽医科学院事业单位类别的通知》（青编办事发〔2018〕6号），确定畜牧兽医科学院为公益一类事业单位，同时将172名差额补贴事业编制调整为全额拨款事业编制。